2013年7月，东南大学与南京高新技术产业开发区管理委员会签署科技创新合作协议，合作共建东南大学国家大学科技园高新园区。该园区由东南大学浦口东校区2万平方米建筑将改造而成。于2016年3月投入运营。重点发展软件及电子信息、先进设备制造、新能源等战略性新兴产业。截至2016年6月，园区现有在孵企业30余家，企业从业人员300余名。
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